Le Tribunal fédéral confirme que la procédure en rappel d'impôt peut être dirigée à l'encontre du débiteur de la prestation imposable, puisque celui-ci se substitue au contribuable. La procédure en rappel d'impôt ne vise rien d'autre qu'à permettre à l'autorité de prélever l'impôt qui n'a pas été perçu à tort. Elle suppose donc qu'une décision ait été rendue par l'autorité fiscale. Le Tribunal fédéral relève en l'espèce que l'instance précédente a omis de contrôler si les conditions du rappel d'impôt étaient réunies. Il admet ainsi le recours de A SA.

Le Tribunal fédéral confirme l'admissibilité des procédures en rappel et soustraction d'impôt ouvertes sur la base d'une dénonciation anonyme, même dans l'éventualité d'un changement de pratique administrative, si elle n'est pas exclue par le droit cantonal de procédure et qu'elle répond à un intérêt public. L'arrêt de la dernière instance cantonale est toutefois annulé pour défaut d'instruction et de motivation.

Les conditions du rappel d’impôt ordinaire sont remplies, les revenus effectifs de l'activité dépendante du contribuable n’ayant été découverts par les autorités fiscales cantonales qu'à la suite du dépôt tardif des déclarations d'impôts 2011 à 2013, alors que les taxations d'office (incomplètes) étaient déjà en force. La demande de révision du contribuable doit quant à elle être déposée dans les 90 jours qui suivent la découverte du motif de révision, ce qui n’était pas le cas en l'espèce.