Résumé : le Tribunal fédéral confirme que la recourante n'a pas démontré la justification commerciale des amortissements annuels annoncés en 2011 et 2012. Par conséquent, c'est à bon droit que l'Afc-GE a procédé, conformément à l'art. 58 al. 1 let. b LIFD, à la reprise de ces amortissements dans le bénéfice annuel correspondant. En outre, selon l'art. 62 al. 4 LIFD, l'Afc-GE était fondée à reprendre dans le bénéfice 2011 de la recourante le montant correspondant à la dissolution du fonds constitué par les amortissements déclarés entre 2005 et 2010. 

I. Faits

La société A SA (ci-après : A SA ou la société), créée en 1976 et inscrite au registre du commerce du canton de Genève, a acquis, le 1er janvier 2005, la totalité des actions de C AG (ci-après : C) au prix de CHF 5'284'200, le 1er janvier 2006 de D AG (ci-après : D) pour un prix de CHF 4'281'376 et, le 24 juillet 2009, de E SA (ci-après : E) pour un prix de CHF 5'762'000.

Dans l'état des titres de sa déclaration fiscale pour 2011, la société a déclaré des "Amortiss./provision" de CHF 467'775 (participation C), CHF 217'672 (participation D) et CHF 500'000 (...